Celem
nauczania przedmiotu „Podstawy bioinformatyki w badaniach nad zdrowotnością
roślin” jest przybliżenie podstawowych pojęć związanych, w głównej mierze, z
analizą lawinowo przyrastających danych sekwencyjnych, strukturalnych i
funkcjonalnych i ich wykorzystaniem w postępie biologicznym. Rozmaite dane,
łącznie z informacjami o genach odporności roślin i genach efektorowych
czynników chorobotwórczych, są powszechnie dostępne rzeszom naukowców oraz praktyków
i podstawową obecnie umiejętnością każdego specjalisty jest korzystanie z nich,
porównanie i analiza własnych wyników w kontekście innych danych. W ciągu
ostatnich kilkunastu lat powstało wiele baz danych i wiele programów
komputerowych pozwalających na korzystanie z wymienionych informacji. Świadom
znaczenia genetycznych uwarunkowań odporności specjalista powinien potrafić
wybrać odpowiednie narzędzie bioinformatyczne, wykorzystać i należycie
zinterpretować otrzymane wyniki. Niezwykle ważną umiejętnością specjalisty
ochrony roślin, którą niniejszy przedmiot uczy, jest również sprawne
posługiwanie się narzędziami i znajomość terminologii związanej z
fizycznymi i genetycznymi mapami, a
także rozumienie znaczenia filogenetyki w genetycznym doskonaleniu roślin dla
poprawy odporności na stresy biotyczne i abiotyczne.
- Autorzy kursu: Marcin Filipecki